Egy nemrégiben készült metagenomikai vizsgálat a Heilongjiang tartományban rágcsálók által hordozott vírusok és baktériumok rendkívül változatos spektrumát tárta fel, beleértve a Lassa vírust, az Amur vírust, a Salmonellát és a Yersinia pestist.
A kutatás felhasználta aKórokozó RNS dúsító készlet a Macro & Micro-Test-től, próbabefogási technológián alapulva. A gazdaszervezet rRNS-ének és más konzervált gazdaszervezet-fragmensek szelektív eltávolításával a módszer hatékonyan visszatartotta a mikrobiális RNS-t, jelentősen javítva a kórokozók kimutatásának érzékenységét. Ez a kórokozó RNS-dúsítási lépés kritikus fontosságú volt a magas kimutatási arány elérésében, és erős technikai támogatást nyújtott a kórokozók megfigyeléséhez.
Rágcsálók: A zoonózisos betegségek fő tározói
A rágcsálók az emlősök legfajgazdagabb és legszélesebb körben elterjedt csoportja, világszerte több mint 2000 fajt foglalnak magukban, és az összes emlősfaj több mint 40%-át teszik ki.
Ökológiai jelentőségükön túl a rágcsálók számos zoonózisos kórokozó fő rezervoárjai és vektorai.Mivel a rágcsálók élőhelyei gyakran átfedésben vannak az emberi környezettel – közvetlen harapások, ürülékkel való érintkezés vagy bolhák és atkák útján történő közvetett átvitel révén –, az általuk hordozott kórokozók állandó közegészségügyi veszélyt jelentenek.
Figyelemre méltó, hogy a felmerülő fertőző betegségek több mint 70%-a vadon élő állatokból származik, a rágcsálók pedig az egyik legjelentősebb vírustárolót jelentik.
Heilongjiang határvidéke: A kórokozók megfigyelésének frontvonala
Hejlungcsiang, egy határ menti tartomány Kína északkeleti részén, bőséges ökológiai erőforrásokkal rendelkezik, és több országgal is határos. A gazdag biodiverzitás és a gyakori, határokon átnyúló népvándorlás kombinációja kedvező feltételeket teremt a kórokozók terjedéséhez.
2021 júniusa és júliusa között a kutatók 67 vadon élő rágcsálót gyűjtöttek Hengdaohezi városában, Mudanjiang városában. A minták a következőket tartalmazták:
20. számApodemus-félsziget
47. oldalMyodes rufocanus
Minden példányt lakóövezetekben és a környező mezőgazdasági területeken fogtak be, kiemelve az emberi települések és a vadon élő állatok élőhelyei közötti szoros kapcsolatot.
Kórokozódúsítási technológia: A gazdaszervezet háttérzavarainak leküzdése
A metagenomikus szekvenálás során a gazdaszervezet RNS-e jellemzően dominál a szekvenálási leolvasásokban, elfedve az alacsony gyakoriságú kórokozó-jeleket.
Ennek a kihívásnak a megoldására a tanulmányMacro & Micro-Test kórokozó metagenomikai kimutatási készlete. A próbabefogási technológia alkalmazásával a speciálisan tervezett próbák a gazdaszervezet rRNS-éhez és konzervált szekvenciáihoz kötődnek, lehetővé téve azok kimerülését és ezáltal a mikrobiális RNS feldúsítását.
Ez a megközelítés jelentősen javította a kórokozók kimutatásának érzékenységét, lehetővé téve a downstream szekvenálást a kórokozók nagyobb arányának kinyerésére. A dúsítási lépés szilárd alapot teremtett a rágcsálók által hordozott kórokozó-spektrum pontos jellemzéséhez.
A dúsítást követően az RNS-minták reverz transzkripción, könyvtárépítésen és nagy áteresztőképességű szekvenáláson estek át. A bioinformatikai elemzés a következőket tartalmazta:
Gazdagép genom szűrése
l Taxonómiai osztályozás Kraken2 segítségével
l Bőségkorrekció saspáfránnyal
Ez a munkafolyamat átfogó profilt készített a vírusos és bakteriális közösségekről.
Kutatási eredmények: Több vírus és baktérium együttes keringése
Vírusos eredmények
A kimutatott vírusok 21 víruscsaládba tartoztak, beleértve aArenaviridaeésHantaviridae.
Keresztülde novoA Megahit segítségével végzett összeállítás során 154 víruskontig keletkezett, amelyek közül 110 nyolc családból származó 19 vírussal illeszkedett.
In Apodemus-félszigeta következő vírusokat azonosították:
l Arenavírusok: Lassa vírus, Wenzhou vírus, Gairo vírus
l Hantavírusok: Amur vírus, Puumala vírus
In Myodes rufocanus, Patkány arterivírust és Amur vírust mutattak ki.
Ezen kórokozók közül:
A Lassa vírus a vírusos vérzéses láz kórokozója, amelynek halálozási aránya eléri a körülbelül 20%-ot.
Az Amur vírus az egyik kórokozó, amely a vesebetegséggel járó vérzéses lázért (HFRS) felelős. Kínában a legnagyobb a hantavírus-fertőzések globális terhe.
Bakteriális leletek
Összesen 1051 baktérium nemzetséget annotáltak.
A leggyakoribb nemzetségek a következők voltak:
lSzalmonella(26–31%)
lYersinia(11–23%)
Szalmonellaegy jelentős, élelmiszer eredetű kórokozó, amely világszerte évente a becslések szerint 9 millió tífuszos megbetegedést és körülbelül 110 000 halálesetet okoz.
Yersinia pestis, a pestis kórokozója, három történelmi világjárványért volt felelős. Hejlungcsiang tartományt Kína egyik természetes pestisgócának tartják, és továbbra is kiemelt régiónak számít a pestis megfigyelése szempontjából.
A tanulmány jelentősége
Tudományos hozzájárulások
Ez a tanulmány az első olyan tanulmány, amely Heilongjiang tartománybeli rágcsálókban Lassa vírusfragmensekről és patkányarteritisz vírusról számol be, bővítve ezzel Kína rágcsálók által terjesztett kórokozó-adatbázisát.
Szisztematikusan jellemzi a helyi rágcsálópopulációk vírus- és baktériumközösségeit, alapadatokat szolgáltatva a zoonózisos betegségek felügyeletéhez a határ menti régiókban.
Közegészségügyi következmények
Az eredmények rávilágítanak a folyamatos megfigyelés és a kórokozó-szűrés szükségességére.A. félszigetésM. rufocanus.
Az adatok tudományos bizonyítékokat szolgáltatnak olyan betegségek forrásellenőrzési stratégiáinak alátámasztására, mint a pestis és a vesebetegséggel járó vérzéses láz.
Módszertani erősségek
A metagenomikai szekvenálás lehetővé teszi mind az ismert, mind az új kórokozók objektív kimutatását.
Ebben a tanulmányban a Macro & Micro-Test kórokozó-dúsítási technológiája kiváló teljesítményt mutatott, hatékonyan javítva a célkórokozók kimutatását összetett biológiai mintákban. Az eredmények megerősítik, hogy képes támogatni a nagy érzékenységű kórokozók azonosítását a vadon élő állatok megfigyelése során.
Termékajánló
A jelen vizsgálatban való sikeres alkalmazás alapján a Macro & Micro-Test Pathogen RNS Enrichment Kit erősen ajánlott a metagenomikai surveillance kutatásokhoz.
A gazdaszervezet nukleinsavainak hatékony csökkentésével és a mikrobiális szekvenciák dúsításával a készlet jelentősen javítja a detektálás érzékenységét és az adatminőséget. Alapvető eszközt jelent a kórokozók pontos felfedezéséhez összetett mintákban, és robusztus technikai támogatást nyújt a közegészségügyi felügyelethez, a zoonózisos kockázatértékeléshez és a járványkitörésekre való felkészüléshez.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Közzététel ideje: 2026. márc. 2.